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En tant qu'organisation indépendante, non partisane et à but non lucratif, le Forum pour le Moyen-Orient et l'Europe du Sud-Est (FOMOSO) fait la promotion de l'opinion sur le Moyen-Orient et l'Europe du Sud-Est en Suisse et dans le monde germanophone.
L'objectif de FOMOSO est de promouvoir l'intérêt pour les processus sociaux et politiques au Moyen-Orient et en Europe du Sud-Est (MOSO) et de les rendre accessibles au plus grand nombre possible. FOMOSO se considère également comme un point de départ pour tous ceux qui se concentrent sur les améliorations sociales et politiques dans MOSO. En ce sens, FOMOSO est aussi considéré comme un réservoir d'idées avec le but de soutenir l'intégration européenne de MOSO afin de travailler dans une Europe diverse et forte.